IPB

Здравствуйте, Гость ( Авторизация | Регистрация )

36 страниц « < 32 33 34 35 36 > 
ОтветитьСоздать новую темуСоздать новое голосование

Схематически · [ Стандартно ] · Линейно

> ДНК-генеалогия

asan-kaygy
post Dec 6 2018, 05:45
Создана #496


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



ГАПЛОГРУППА R1A-Z2122 В ПОПУЛЯЦИИ БАЛКАРЦЕВ И КАРАЧАЕВЦЕВ ПО ДАННЫМ 23 Y-STR

Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Литвинов С.С., Габидуллина Л.Р., Хуснутдинова Э.К. Башкирский государственный университет, г. Уфа, Россия

Географические, исторические, этнологические, а так же культурные особенности территории Кавказа всегда вызывали особый интерес к изучению этого уникального региона. Повышенное внимание авторов было уделено тюркоязычным популяциям центральной части Северного Кавказа, а именно балкарцам и карачаевцам.

В целом численность балкарцев и карачаевцев в России и зарубежных странах насчитывает около 460 тыс. человек. Большинство представителей этих народов компактно проживают в Карачаево-Черкесской и Кабардино-Балкарской республиках. Среди балкарцев выделяют 5 субэтнических групп (баксанцы, чегемцы, холамцы, безенгиевцы и малкарцы), заселяющих одноименные ущелья Центрального Кавказа.

В популяционно-генетических исследованиях в качестве молекулярно-генетических маркеров широко используются микросателлиты (STR - Short tandem repeats). Из-за высокой степени изменчивости и высокой степени аллельного полиморфизма, короткие тандемные повторы (STR) показывают недавние события в истории изучаемой популяции.

На секвенаторе Applied Biosystems 3730xl нами были проанализированы микросателлитные локусы (DYS19, DYS385, DYS389 I, DYS389 II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439, DYS448, DYS456, DYS458, DYS481, DYS533, DYS549, DYS570, DYS576, DYS635, DYS643, YGATAH4) среди представителей гаплогруппы R1a-Z2122 из популяции балкарцев и карачаевцев.

С частотой 2,4% данная гаплогрупа обнаружена в популяции карачаевцев и 3,4% в популяции балкарцев. Что интересно, в субэтносе чегем частота R1a-Z2122 составляет 6,8%, что является абсолютным максимумом для всех изученных народов Кавказа. Для углубленного изучения этой гаплогруппы произведено гаплотипирование по 23 Y-STR. Крайне скудные данные Y-STR с гаплотипами из популяций других регионов не позволили определить генетическую связь с иными регионами, но всё же выявляется довольно существенная вариабельность внутри нашей выборки.

стр.394

http://matem.anrb.ru/bsuconf/2018/tezisu.pdf


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Dec 6 2018, 05:46
Создана #497


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



ВОСТОЧНОЕВРАЗИЙСКАЯ ГАПЛОГРУППА R1B-M478 В ПОПУЛЯЦИИ БАЛКАРЦЕВ ПО ДАННЫМ Y-STR

Джаубермезов Мурат Алиевич, Аспирант, Башкирский государственный университет, muratkbr12@gmail.com

Екомасова Наталья Вадимовна, К.б.н., доцент, Башкирский государственный университет trofimova_nata_@mail.ru

Литвинов Сергей Сергеевич К.б.н., с.н.с., Институт биохимии и генетики—обособленное структурное подразделение ФГБНУ Уфимского федерального исследовательского центра РАН seregtg@gmail.com

Габидуллина Лилия Рафисовна Башкирский государственный университет, liliya.gab@gmail.com

Хуснутдинова Эльза Камилевна Д.б.н., профессор, Башкирский государственный университет, Институт биохимии и генетики—обособленное структурное подразделение ФГБНУ Уфимского федерального исследовательского центра РАН elzakh@mail.ru

Аннотация. Проведён анализ генетического разнообразия популяции балкарцев проживающих в центральной части Северо-Кавказского региона по данным о Y-STR (Short tandem repeats). Выявлено 13,6% населения относящиеся к гаплогруппе R1b-М343, из которых 11,5% к одной из её ветвей—R1b-M478. Нами проведено гаплотипирование образцов относящихся к гаплогруппе R1b-M478. В результате построения медианной сети была показана кластеризация балкарцев с мегрелами и карачаевцами, а также их удаление от остальных изученных индивидов в том числе от тюркоязычных башкир, татар, а также географических соседей — кабардинцев. Для оценки генетического взаимоотношения по данным Y-STR между балкарцами и другими изученными популяциями, нами был проведен анализ главных компонент. По результатам данного анализа кластеризация балкарцев, карачаевца и мегрела сохранилась, что говорит об их генетическом родстве.

http://www.vipstd.ru/index.php/серия-естес...20-nt-2018-06-1


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Dec 7 2018, 06:04
Создана #498


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



Ancient DNAs and the Neolithic Chinese super-grandfather Y haplotypes

Ye Zhang, Xiaoyun Lei, Hongyao Chen, Hui Zhou, Shi Huang
doi: https://doi.org/10.1101/487918

Abstract

Previous studies identified 3 Neolithic Han Chinese super-grandfather Y haplotypes, O2a2b1a1a-F5, O2a2b1a2a1-F46, and O2a1b1a1a1a-F11, but their relationships with the archaeological and written records remain unexplored. We here report genome wide DNA data for 12 ancient samples (0.02x-1.28x) from China ranging from 6500 to 2500 years before present (YBP). They belonged to 4 different genetic groups, designated as Dashanqian (DSQ) of Xiajiadian Culture in the Northeast, Banpo (BP) of middle Yangshao Culture in the Central West, Zhengzhou Xishan (ZX) of Miaodigou Culture in the Central Plains, and Others. Present day F5 samples were closer in autosomal distances to the ZX and DSQ groups while F11, C, O1, and O2 samples were closer to the BP group. We also sequenced the Y chromosome of one of these ancient samples K12 from DSQ and found both K12 and a previously reported ~4000 year old sample MG48 from Northwest China to have the O2a2b1a1a1a2a-F2137 haplotype, belonging to the most prolific branch O2a2b1a1a1-F438 immediately under F5. We further found close relationships between ZX and DSQ and between ZX and ancient M117 Tibetans or present day Southwest Dai Chinese carrying the F5 subtype O2a2b1a1a6, implicating radiations of F5 subtypes from the putative place of F5 origin in ZX. These results are remarkably consistent with archaeological and written records.

Sample name Ages (BP) # SNPs slow Coverage Culture Sites
FQ17 2500 1200 0.113 East Zhou Fushan Qiaobei, Shanxi
K2 3000 8300 1.2796 Xiajiadian Upper Dashanqian, Chifeng, Inner Mongolia
K12 3000 2000 0.2071 Xiajiadian Upper Dashanqian, Chifeng, Inner Mongolia
S1 3920 350 0.043 Xiaoheyan Halahaigou, Chifeng, Inner Mongolia
SG2046 3500 1500 0.1668 Xiajiadian Lower Sanguan, Hebei
DZ14 5000 1980 0.0712 Late Yangshao Duzhong, Mianchi Henan
BP38 6500 966 0.0556 Yangshao Banpo, Xian
ZX167 5300 3722 0.0674 Miaodigou Zhengzhou Xishan,Henan
ZX107 5300 161 0.0179 Miaodigou Zhengzhou Xishan,Henan
PAB3002 3000 2300 0.2361 Gaotaishan Pinganbao, Liaoning
ZK22 4200 500 0.0485 Zhukaigou Zhukaigou, Ordos, Inner Mongolia
H69 3500 1692 0.0304 Early Shang Xuecun, Zhengzhou,Henan


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Dec 24 2018, 06:17
Создана #499


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



https://www.cell.com/current-biology/fullte...9822(18)31495-7

Y Chromosome Sequences Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population structure of Native American Founders

Thomaz Pinotti, Anders Bergström, Maria Geppert, Matt Bawn, Dominique Ohasi, Wentao Shi, Daniela R. Lacerda, Arne Solli, Jakob Norstedt, Kate Reed, Kim Dawtry, Fabricio González-Andrade, Cesar Paz-y-Miño, Susana Revollo, Cinthia Cuellar, Marilza S. Jota, José E. Santos Jr., Qasim Ayub, Toomas Kivisild 16, José R. Sandoval, Ricardo Fujita, Yali Xue, Lutz Roewer, Fabrício R. Santos, Chris Tyler-Smith 17

Open Access
Published: December 20, 2018
DOI:https://doi.org/10.1016/j.cub.2018.11.029

Highlights
• We sequenced 20 Native American Y chromosomes chosen for their genetic diversity
• A Beringian Standstill of <4,600 years led to both Siberian and American Y-lineages
• Y-lineage split times rule out occupation of the Americas before 19,500 years ago
• Present-day male population structure in South America arose before 12,000 years ago

Summary

The Americas were the last inhabitable continents to be occupied by humans, with a growing multidisciplinary consensus for entry 15–25 thousand years ago (kya) from northeast Asia via the former Beringia land bridge [1, 2, 3, 4]. Autosomal DNA analyses have dated the separation of Native American ancestors from the Asian gene pool to 23 kya or later [5, 6] and mtDNA analyses to ∼25 kya [7], followed by isolation (“Beringian Standstill” [8, 9]) for 2.4–9 ky and then a rapid expansion throughout the Americas. Here, we present a calibrated sequence-based analysis of 222 Native American and relevant Eurasian Y chromosomes (24 new) from haplogroups Q and C [10], with four major conclusions. First, we identify three to four independent lineages as autochthonous and likely founders: the major Q-M3 and rarer Q-CTS1780 present throughout the Americas, the very rare C3-MPB373 in South America, and possibly the C3-P39/Z30536 in North America. Second, from the divergence times and Eurasian/American distribution of lineages, we estimate a Beringian Standstill duration of 2.7 ky or 4.6 ky, according to alternative models, and entry south of the ice sheet after 19.5 kya. Third, we describe the star-like expansion of Q-M848 (within Q-M3) starting at 15 kya [11] in the Americas, followed by establishment of substantial spatial structure in South America by 12 kya. Fourth, the deep branches of the Q-CTS1780 lineage present at low frequencies throughout the Americas today [12] may reflect a separate out-of-Beringia dispersal after the melting of the glaciers at the end of the Pleistocene.

Основные моменты

• Мы секвенировали 20 индейских Y-хромосом, выбранных с учетом их генетического разнообразия

• Берингийский застой длительностью менее 4600 лет привел к появлению как сибирских, так и американских Y-линий

• Времена разделения Y-линий исключают заселение Америки древнее 19 500 лет назад

• Современная структура мужского населения в Южной Америке возникла до 12 000 лет назад

Резюме

Северная и Южная Америка были последними обитаемыми континентами, которые были заняты людьми, с растущим междисциплинарным консенсусом для входа 15-25 тысяч лет назад (тлн) из Северо-Восточной Азии через бывший берингийский сухопутный мост [1, 2, 3, 4]. Аутосомный анализ ДНК датировал отделение предков американских индейцев от азиатского генофонда до 23 тыс. лет назад или позже [5, 6], а анализ мтДНК - до 25 тыс. лет назад [7] с последующей изоляцией («Берингский застой» [8, 9]). ) на 2,4–9 тыс. лет, а затем быстрое распространение по всей Америке. Здесь мы представляем калиброванный, основанный на секвенировании, анализ 222 индейских и соответствующих евразийских Y-хромосом (24 новых) из гаплогрупп Q и C [10], с четырьмя основными выводами. Во-первых, мы определяем три-четыре линии независимого происхождения как автохтонные и вероятна предковые: основная Q-M3 и более редкая Q-CTS1780, присутствующие в Северной и Южной Америке, очень редкая C3-MPB373 в Южной Америке и, возможно, C3-P39 / Z30536 в Северной Америке. Во-вторых, исходя из времени расхождения и евразийско-американского распределения линий, мы оцениваем продолжительность Берингийского застоя в 2,7 тыс. лет или 4,6 тыс. лет, согласно альтернативным моделям, и продвижение к югу от ледяного покрова после 19,5 тыс. лет. Назад. В-третьих, мы описываем звездообразное расширение Q-M848 (в пределах Q-M3), начиная с 15 тыс. лет назад [11] в Северной и Южной Америке, с последующим установлением существенной пространственной структуры в Южной Америке к 12 тыс. лет. назад. В-четвертых, глубокие ветви линии Q-CTS1780, присутствующие сегодня на низких частотах по всей Северной и Южной Америке [12], могут отражать отдельное расселение из Берингии после таяния ледников в конце плейстоцена.


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Dec 26 2018, 07:21
Создана #500


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



https://link.springer.com/article/10.1007/s00438-018-1469-7
A new self-learning computational method for footprints of early human migration processes


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Dec 27 2018, 08:49
Создана #501


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jan 3 2019, 12:01
Создана #502


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



YFull: 137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes

https://www.yfull.com/samples-from-paper/10/


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jan 4 2019, 13:37
Создана #503


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jan 21 2019, 06:30
Создана #504


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



Перепост:
https://ancientdnahub.com/#main_map_page

"Очередной проект по выносу данных дДНК на карту. От Эрана Элхаика".


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jan 23 2019, 09:19
Создана #505


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



Перепост
QUOTE
Авраам - J1-YSC0000234, ВВ=ВБОП~5600 лет назад
Иаков (легендарный прародитель евреев) - J1-Y3081, ВВ~5600 лет назад, ВБОП ~5400 лет назад
Исмаил (легендарный прародитель арабов-аднанитов) - J1-Z1884, ВВ~5600 лет назад, ВБОП ~4600 лет назад
Аарон (легендарный прародитель коэнов, брат Моисея) -  J1-Y3088, ВВ ~5400 лет назад, ВБОП ~2900 лет назад
Али (легендарный прародитель сеидов) - J1-Y12361, ВВ=ВБОП~1450 лет назад

https://yfull.com/tree/J-YSC0000234/
https://yfull.com/tree/J-Y3081/
https://yfull.com/tree/J-Z1884/
https://yfull.com/tree/J-Y3088/
https://yfull.com/tree/J-Y12361/


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jan 23 2019, 13:11
Создана #506


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



QUOTE
к узлу YSC0000234 сходятся предковые линии субклада L859 с высокой концентрацией курайшитов и Y3088 с высокой концентрацией коэнов. Но тогда в потомки генетического Исмаила попадают также евреи и европейцы, а в потомки генетического Исаака - арабы и европейцы.

1) Выявлено, что большинство сеидов относится к  J1-Y12361, ВБОП~1450 лет назад, что согласуется с исторической хронологией
2) Выявлено, что большинство коэнов относится к    J1-Y3088, ВБОП ~2900 лет назад, что согласуется с исторической хронологией
3) Поскольку предковым для J1-Y12361 и J1-Y3088 узлом для арабского и еврейского духовных сословий является J1-YSC0000234, то выдвинуто предположение о соотнесении этого снипа с Авраамом, учитывая что его ВБОП составляет 5600 лет, что согласуется с периодом становления Ура Халдейского - родины ветхозаветного Авраама
4) Узлы J1-Y3081 и J1-Z1884 выбраны в качестве "иакобического" и "исмаилического" исключительно филогенгетически, как две нисходящие от Авраама точки коалесценции арабо-сеидских и еврейско-коэнских линий.
Все ВБОП формально вписываются в документальную хронологию авраамических религий.


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jan 25 2019, 09:17
Создана #507


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



Волков В.Г., Каримов А.А., Сабитов Ж.М. Юсупов Ю.М. Происхождение и родственные связи родоплеменного объединения Тамьян по данным генетических исследований// История башкирских родов. Тамьян. Том 32. Уфа: ИИЯЛ УНЦ РАН; Китап, 2018. С. 220-233.
https://www.academia.edu/38216570/%D0%92%D0...%D0%A1._220-233


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jan 30 2019, 05:52
Создана #508


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



QUOTE
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.23789

The genetic legacy of the Yaghnobis: A witness of an ancient Eurasian ancestry in the historically reshuffled central Asian gene pool

Elisabetta Cilli, Stefania Sarno, Guido Alberto Gnecchi Ruscone, Patrizia Serventi, Sara De Fanti, Paolo Delaini, Paolo Ognibene, Gian Pietro Basello, Gloria Ravegnini, Sabrina Angelini, Gianmarco Ferri, Davide Gentilini, Anna Maria Di Blasio, Susi Pelotti, Davide Pettener, Marco Sazzini, Antonio Panaino, Donata Luiselli, Giorgio Gruppioni

First published: 29 January 2019
https://doi.org/10.1002/ajpa.23789

Abstract

Objectives

The Yaghnobis are an ethno‐linguistic minority historically settled along the Yaghnob River in the Upper‐Zarafshan Valley in Tajikistan. They speak a language of Old Sogdian origin, which is the only present‐day witness of the Lingua Franca used along the Silk Road in Late Antiquity. The aim of this study was to reconstruct the genetic history of this community in order to shed light on its isolation and genetic ancestry within the Euro‐Asiatic context.
Materials and Methods

A total of 100 DNA samples were collected in the Yaghnob and Matcha Valleys during several expeditions and their mitochondrial, Y‐chromosome and autosomal genome‐wide variation were compared with that from a large set of modern and ancient Euro‐Asiatic samples.

Results

Findings from uniparental markers highlighted the long‐term isolation of the Yaghnobis. Mitochondrial DNA ancestry traced an ancient link with Middle Eastern populations, whereas Y‐chromosome legacy showed more tight relationships with Central Asians. Admixture, outgroup‐f3, and D‐statistics computed on autosomal variation corroborated Y‐chromosome evidence, pointing respectively to low Anatolian Neolithic and high Steppe ancestry proportions in Yaghnobis, and to their closer affinity with Tajiks than to Iranians.

Discussion

Although the Yaghnobis do not show evident signs of recent admixture, they could be considered a modern proxy for the source of gene flow for many Central Asian and Middle Eastern groups. Accordingly, they seem to retain a peculiar genomic ancestry probably ascribable to an ancient gene pool originally wide spread across a vast area and subsequently reshuffled by distinct demographic events occurred in Middle East and Central Asia.


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Feb 1 2019, 08:34
Создана #509


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Feb 1 2019, 08:36
Создана #510


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5461
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение

ОтветитьОпции темыСоздать новую тему
1 человек читают эту тему (1 гостей и 0 скрытых пользователей)
0 пользователей:
 

Упрощенная Версия Сейчас: 12th December 2019 - 22:25

Ссылки: