IPB

Здравствуйте, Гость ( Авторизация | Регистрация )

ОтветитьСоздать новую темуСоздать новое голосование

Схематически · [ Стандартно ] · Линейно

> ДНК-генеалогия

asan-kaygy
post May 18 2020, 09:37
Создана #541


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



QUOTE
https://www.cambridge.org/core/journals/evolutionary-human-sciences/article/bioarchaeological-perspective-on-the-expansion-of-transeurasian-languages-in-neolithic-amur-river-basin/70D28FAB333D120EA9F4701AE192C891/core-reader

Bioarchaeological perspective on the expansion of Transeurasian languages in Neolithic Amur River basin

    Yinqiu Cui (a1) (a2), Fan Zhang (a2), Pengcheng Ma (a2), Linyuan Fan (a2), Chao Ning (a2) (a3), Quanchao Zhang (a4), Wei Zhang (a5), Lixin Wang (a1) and Martine Robbeets (a3)

    All author information showing
        (a1)        1Research Center for Chinese Frontier Archaeology, Jilin University, Changchun130012, China
        (a2)        2School of Life Sciences, Jilin University, Changchun130012, China
        (a3)        3Eurasia3angle, Max Planck Institute for the Science of Human History, JenaD-07745, Germany
        (a4)        4School of Archaeology, Jilin University, Changchun130012, China
        (a5)        5Heilongjiang Provincial Institute of Cultural Relics and Archaeology, Harbin150008, P. R. China

        DOI: https://doi.org/10.1017/ehs.2020.16

        Published online by Cambridge University Press: 14 May 2020

Abstract

Owing to the development of sequencing technology, paleogenomics has become an important source of information on human migration and admixture, complementing findings from archaeology and linguistics. In this study, we retrieved the whole genome and Y chromosome lineage from late Neolithic Honghe individuals in the Middle Amur region in order to provide a bioarchaeological perspective on the origin and expansion of Transeurasian languages in the Amur River basin. Our genetic analysis reveals that the population of the Amur River basin has a stable and continuous genetic structure from the Mesolithic Age up to date. Integrating linguistic and archaeological evidence, we support the hypothesis that the expansion of the Transeurasian language system in the Amur River basin is related to the agricultural development and expansion of the southern Hongshan culture. The spread of agricultural technology resulted in the addition of millet cultivation to the original subsistence mode of fishing and hunting. It played a vital role in the expansion of the population of the region, which in its turn has contributed to the spread of language.

Благодаря развитию технологии секвенирования палеогеномика стала важным источником информации о миграции и смешении людей, дополняя результаты археологии и лингвистики. В этом исследовании мы извлекли весь геном и Y-хромосомную линию от поздненеолитических особей Хунхэ в среднем Приамурье, чтобы обеспечить биоархеологическую перспективу происхождения и распространения трансевразийских языков в бассейне реки Амур. Проведенный нами генетический анализ показал, что население бассейна реки Амур имеет устойчивую и непрерывную генетическую структуру, начиная с эпохи мезолита и до настоящего времени. Объединяя лингвистические и археологические данные, мы поддерживаем гипотезу о том, что экспансия трансевразийской языковой системы в бассейне реки Амур связана с сельскохозяйственным развитием и экспансией южной хуншаньской культуры. Распространение сельскохозяйственных технологий привело к тому, что к первоначальному способу жизнеобеспечения - рыболовству и охоте - добавилось выращивание проса. Это сыграло важную роль в расширении населения региона, что, в свою очередь, способствовало распространению языка.

Образец мтДНК Y-ДНК
HQHM2 D4c1b C2a
HQHM3 D4j
HQHM4 D4b2a Q1a1a, F1907-
HQHM5 D4


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post May 27 2020, 16:02
Создана #542


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post May 29 2020, 05:28
Создана #543


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jun 8 2020, 05:05
Создана #544


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jun 17 2020, 04:50
Создана #545


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



перепост:
QUOTE
https://www.pnas.org/content/early/2020/06/15/2004944117

A high-coverage Neandertal genome from Chagyrskaya Cave

Fabrizio Mafessoni, Steffi Grote, Cesare de Filippo, Viviane Slon, Kseniya A. Kolobova, Bence Viola, Sergey V. Markin, Manjusha Chintalapati, Stephane Peyrégne, Laurits Skov, Pontus Skoglund, Andrey I. Krivoshapkin, Anatoly P. Derevianko, Matthias Meyer, Janet Kelso, Benjamin Peter, Kay Prüfer, and Svante Pääbo

PNAS first published June 16, 2020 https://doi.org/10.1073/pnas.2004944117

Contributed by Svante Pääbo, May 13, 2020 (sent for review March 16, 2020; reviewed by Kelley Harris and Roberto Macchiarelli)

Significance

We present the third high-quality genome to be determined from a Neandertal. Patterns of variation in the genome suggest that her ancestors lived in relatively isolated populations of less than 60 individuals. When we analyze this genome together with two previously sequenced Neandertal genomes, we find that genes expressed in the striatum of the brain may have changed especially much, suggesting that the striatum may have evolved unique functions in Neandertals.

Abstract

We sequenced the genome of a Neandertal from Chagyrskaya Cave in the Altai Mountains, Russia, to 27-fold genomic coverage. We show that this Neandertal was a female and that she was more related to Neandertals in western Eurasia [Prüfer et al., Science 358, 655–658 (2017); Hajdinjak et al., Nature 555, 652–656 (2018)] than to Neandertals who lived earlier in Denisova Cave [Prüfer et al., Nature 505, 43–49 (2014)], which is located about 100 km away. About 12.9% of the Chagyrskaya genome is spanned by homozygous regions that are between 2.5 and 10 centiMorgans (cM) long. This is consistent with the fact that Siberian Neandertals lived in relatively isolated populations of less than 60 individuals. In contrast, a Neandertal from Europe, a Denisovan from the Altai Mountains, and ancient modern humans seem to have lived in populations of larger sizes. The availability of three Neandertal genomes of high quality allows a view of genetic features that were unique to Neandertals and that are likely to have been at high frequency among them. We find that genes highly expressed in the striatum in the basal ganglia of the brain carry more amino-acid-changing substitutions than genes expressed elsewhere in the brain, suggesting that the striatum may have evolved unique functions in Neandertals.


Значимость

Мы представляем третий высококачественный геном, полученный из неандертальца. Различия в геноме позволяют предположить, что ее предки жили в относительно изолированных популяциях, состоящих менее чем из 60 особей. При анализе этого генома вместе с двумя ранее секвенированными неандертальскими геномами мы обнаруживаем, что гены, экспрессированные в полосатом теле мозга, возможно, особенно сильно изменились, что позволяет предположить, что в полосатом теле могли развиваться уникальные функции у неандертальцев.

Аннотация

Мы секвенировали геном неандертальца из Чагырской пещеры в Алтайских горах, Россия, до 27-кратного геномного покрытия. Мы показываем, что эта неандерталька была женщиной и была больше связана с неандертальцами в западной Евразии [Prüfer et al., Science 358, 655-658 (2017); Hajdinjak et al., Nature 555, 652-656 (2018)], чем с неандертальцами, жившими ранее в Денисовой пещере [Prüfer et al., Nature 505, 43-49 (2014)], которая расположена примерно в 100 км. Около 12,9% генома Чагырской занимают гомозиготные области, которые имеют длину от 2,5 до 10 сантиморганов (см). Это согласуется с тем, что сибирские неандертальцы проживали в относительно изолированных популяциях менее 60 особей. Напротив, неандерталец из Европы, денисовец с Алтайских гор и древние современные люди, похоже, жили в популяциях больших размеров. Наличие трех неандертальских геномов высокого качества позволяет взглянуть на генетические особенности, которые были уникальны для неандертальцев и которые, вероятно, были среди них на высокой частоте. Мы обнаружили, что гены, сильно экспрессированные в полосатом теле в базальных ганглиях мозга, несут больше аминокислотных замен, чем гены, экспрессированные в других местах мозга, что позволяет предположить, что в полосатом теле, возможно, развивались уникальные функции у неандертальцев.


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jun 27 2020, 05:42
Создана #546


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jun 27 2020, 05:44
Создана #547


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jul 4 2020, 11:32
Создана #548


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



Перепост с молгена:
"Интересная находка — основной генетический вариант, предрасполагающий к тяжелым формам COVID-19 был унаследован от неандертальцев https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.03.186296v1…
"Статья пока только в виде препринта, но авторы солидные (в отл. от многих других скороспелых статей про этот вирус), и они ссылаются на ряд предыдущих исследований. Выявлен небольшой участок генома, наличие которого повышает риск заболеть covid-19 именно в тяжелой форме. Ген передан нам от неандертальцев (при нашем с ними скрещивании ок. 50 тыс лет назад). Интересно сегодняшнее распределение гена по планете.
- Южная Азия: ~30% популяции,
- Европа: ~8%,
- США: ~4%,
- Восточная Азия: < 4%,
- Африка: ~0% (скрещивания происходили после нашего исхода из Африки).
P.S. Отмечу, что, разумеется, никакими эпидемиологическими моделями этот момент не учитывался. Как не учитывались уровень коррумпированности и (не)компетентности властей, состояние здравоохранения, специфика быта и гигиены популяции и ряд других факторов, радикально влияющих на импакт болезни. Зато наукообразные сферические в вакууме модели распространения вируса со сложным матаппаратом хорошо подходят для разжигания паники у населения и истерии у властей."


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jul 4 2020, 13:03
Создана #549


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



https://www.biorxiv.org/content/10.1101/202...Vpy8Kh4rgClHuEU

Lehti Saag, Sergey V. Vasilyev, Liivi Varul, Natalia V. Kosorukova, Dmitri V. Gerasimov, Svetlana V. Oshibkina, Samuel J. Griffith, Anu Solnik, Lauri Saag, Eugenia D'Atanasio, Ene Metspalu, Maere Reidla, Siiri Rootsi, Toomas Kivisild, Christiana Lyn Scheib, Kristiina Tambets, Aivar Kriiska, Mait Metspalu

Genetic ancestry changes in Stone to Bronze Age transition in the East European plain


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jul 7 2020, 13:06
Создана #550


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jul 8 2020, 05:02
Создана #551


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jul 9 2020, 06:02
Создана #552


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jul 9 2020, 06:59
Создана #553


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Jul 9 2020, 09:04
Создана #554


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414





--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
post Сегодня, 09:08
Создана #555


Цензор
*************

Группа: Пользователи
Сообщений: 5573
Зарегистрирован: 6-May 08
Пользователь №: 1414



QUOTE
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.13.200154v1

Early Medieval Genetic Data from Ural Region Evaluated in the Light of Archaeological Evidence of Ancient Hungarians

Veronika Csaky, Daniel Gerber, Bea Szeifert, Balazs Egyed, Balazs Stegmar, Sergej Gennad'evich Botalov, Ivan Valer'evich Grudochko, Natalja Petrovna Matvejeva, Alexander Sergejevich Zelenkov, Anastasija Viktorovna Slepcova, Rimma D. Goldina, Andrey V. Danich, Balazs G. Mende, Attila Turk, Anna Szecsenyi-Nagy

doi: https://doi.org/10.1101/2020.07.13.200154

Abstract

The ancient Hungarians originated from the Ural region of Russia, and migrated through the Middle-Volga region and the Eastern European steppe into the Carpathian Basin during the 9th century AD. Their Homeland was probably in the southern Trans-Ural region, where the Kushnarenkovo culture disseminated. In the Cis-Ural region Lomovatovo and Nevolino cultures are archaeologically related to ancient Hungarians. In this study we describe maternal and paternal lineages of 36 individuals from these regions and nine Hungarian Conquest period individuals from today's Hungary, as well as shallow shotgun genome data from the Trans-Uralic Uyelgi cemetery. We point out the genetic continuity between the three chronological horizons of Uyelgi cemetery, which was a burial place of a rather endogamous population. Using phylogenetic and population genetic analyses we demonstrate the genetic connection between Trans-, Cis-Ural and the Carpathian Basin on various levels. The analyses of this new Uralic dataset fill a gap of population genetic research of Eurasia, and reshape the conclusions previously drawn from 10-11th century ancient mitogenomes and Y-chromosomes from Hungary.

Древние венгры происходят из Уральского региона России и мигрировали через Среднее Поволжье и Восточно-Европейскую степь в Карпатскую котловину в IX веке нашей эры. Их Родина, вероятно, находилась в южном Зауралье, где распространялась Кушнаренковская культура. В Приуралье Ломоватовская и Неволинская культуры археологически связаны с древними венграми. В данном исследовании мы описываем материнские и отцовские линии 36 особей из этих регионов и девять особей периода Венгерского завоевания из сегодняшней Венгрии, а также данные о геноме неглубокого покрытия с Зауральского кладбища Уелги. Мы указываем на генетическую преемственность между тремя хронологическими горизонтами кладбища Уелги, которое являлось местом захоронения довольно эндогамной популяции. Используя филогенетический и популяционно-генетический анализ, мы демонстрируем генетическую связь между Зауральем, Приуральем и Карпатским бассейном на различных уровнях. Анализ этого нового уральского массива данных заполняет пробел в популяционно-генетических исследованиях Евразии и переосмысливает выводы, сделанные ранее по древним митогеномам 10-11 вв. и Y-хромосомам Венгрии.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)


--------------------
Пользователь offlineПрофайлОтправить личное сообщение
Вернуться к началу страницы
+Цитировать сообщение

ОтветитьОпции темыСоздать новую тему
2 человек читают эту тему (2 гостей и 0 скрытых пользователей)
0 пользователей:
 

Упрощенная Версия Сейчас: 14th July 2020 - 16:04

Ссылки: