Portus Julius был заказан Марком Випсанием Агриппой во время гражданской войны между Октавианом и Секстом Помпеем (в 37 г. до н. э.). Великолепная гавань была для арсенала Classis Misenensis (Мизенского флота), который был самым важным римским флотом. Строительные работы доверялись архитектору Луцию Целию Акту, изобретательность которого связала гавань с озерами Лукринским и Авернским судоходным каналом, а после Кум подземным туннелем длиной 1 км, по которому согли пройти повозки. Гавань называлась в честь цезаря Гая Юлия.
После окончания Portus Julius предлагал обширный ряд административных услуг, связанных с мореплаванием: склад для снабжения, цистерны для питьевой воды, сухие доки для ремонта корабельных корпусов и цеха для ремонта парусов. Для других, скорее личных, потребностей были также предусмотрены: развлекательные заведения, храм Посейдона, и тайные притоны.
Однако, военная жизнь гавани была короткой из-за заноса песком. Уже в 12 г. до н. э. императорский флот перебазировался на близлежащие естественные бассейны Мизена, и гавань стала использоваться для гражданских целей. Это было место, откуда галеры по команде морского командующего Гая Плиния Секунда Старшего посылались для эвакуации испуганных жителей Помпей и Геркуланума во время опустошительного извержения Везувия в 79 г. н.э..
В течение тысячелетий первоначальный комплекс подвергался брадисейсму(движениям Земли, вызванным изменениями объема магмы и/или гидротермальной активностью). В конце V в.н.э. сенатор Флавий Магн Аврелий Кассиодор утверждал, что внешний волнорез гавани опустился. В течение следующих столетий он совсем исчез; Лукринское озеро было воссоединено с морем. Это движение линии побережья продолжалось до 29 сентября 1538 г., когда извержение вулкана произошло, при котором появилась так называемая Новая гора, деревня Трипергола была разрушены и озеро Лукрино уменьшилось до размера немногим больше, чем пруд.
Portus Julius снова обнаружен аэрофотосъемками во время Второй мировой войны. Фотографии иллюстрируют топографию обширного комплекса, площадью примерно 10 га. Можно идентифицировать склады, а также различные колонны, которые обозначают внутренние дворы жилых домов. За последнее время удалось составить общую карту в основном из этих фотографий.
Тем не менее, подробности строительства гавани удалось узнать подводными исследованиями и наблюдениями. Стены и колонны поднимаются от нескольки см до больше чем 1 м над уровнем моря, и исследование каменных стен свидетельствует об использовании различных строительных методов, в частности, сетчатой каменной стене. Сохранились дороги, напольные мозаики, керамика и даже часть фресок.