Почти гомункулус

b-graf

Принцепс сената
Первая в мире операция по пересадке генома позволила превратить один вид бактерий в другой
09.07.2007 04:28 | "ЭЛЕМЕНТЫ"
http://www.rambler.ru/news/science/dolly/10720696.html

"В ближайшие месяцы" впервые будет получена искусственная жизнь
02.07.2007 16:25 | Инопресса
http://www.rambler.ru/news/science/dolly/527892851.html
Мы научились читать ДНК, а теперь учимся ее "писать"
 

AlexeyP

Принцепс сената
Это потрясающе.
Я думаю, наши депутаты Государственной Думы обязаны срочно принять закон, запрещающий создавать жизнь искусственным путём на территории РФ. Если они этого не сзелают, то сильно пострадает их репутация, как ригидных кретинов.
 

Diletant

Великий Магистр
Боюсь, как бы Конгресс еще раньше не принял закон, запрещающий делать это во всем мире под угрозой коврового бомбардирования... Тогда наши депутаты будут бессильны...
 

b-graf

Принцепс сената
Создана искусственная хромосома
http://news.mail.ru/society/1581005/
"В прошлом году Вентер и Смит создали гибридный организм, пересадив гены одной бактерии в другую. Та жила и размножалась. После этого исследователи и занялись синтезом искусственной ДНК. В результате получилась цепочка, состоящая из 582 тысяч звеньев. И воспроизводящая 485 генов бактерии — полный ее геном. Если верить Вентеру, то это крупнейшая из когда-либо созданных искусственных цепочек — по длине она превышает предыдущие достижения более чем в 20 раз...

Теперь ученым предстоит сделать последний шаг. Они намерены ввести синтетическую хромосому в клетку, чтобы она воспроизвела себя и превратилась в новую форму жизни — искусственную.

Смит сравнивает свое достижение с завершением работы над компьютерной операционной системой...

В планах ученого искусственные микробы, способные производить топливо. "
 

Кныш

Moderator
Команда форума
В планах ученого искусственные микробы, способные производить топливо.

Вона чего супастаты задумали. :mad: На наш статус энергетической супердержавы хочут покусится. :D Ну ничо, наши доблестные ученые ответят на их синтетических микробов синтетическими антибиотиками.
cool.gif
 

b-graf

Принцепс сената
Получен синтетический аналог ДНК
05.05.2008 14:51 | Радио Свобода
http://www.rambler.ru/news/science/0/12686249.html
«Исследователи из Института Биодизайна Университета Аризоны (Biodesign Institute at Arizona State University)…
вместо углевода дезоксирибозы, использовали более простой глицерин...
Полученная молекула получила название ГНК. Молекула не только может создавать свою точную копию, но обладает также новыми свойствами. В частности ГНК может создавать свою зеркально симметричную копию и выдерживает значительно более высокую температуру.»
 

b-graf

Принцепс сената
Еще было (может уже запостил, не помню)

Американские химики нашли пару новых букв в "генетический алфавит" ДНК
30.01.2008 21:45 | Газета.ru
http://www.rambler.ru/news/science/dolly/555475702.html

"Американские химики нашли пару молекул, которые способны стать новыми буквами в генетическом коде ДНК.
...
Ромесберг рассказал журналу New Scientist, что его группа уже в течение долгого времени ищет новые буквы для ДНК, и его коллеги даже составили каталог 200 молекул, которые – в теории – могли бы работать в качестве носителей самореплицируемой генетической информации. Однако на поверку оказалось, что ни одна из них не может копироваться естественными клеточными ферментами. Тогда учёные применили другой метод, синтезируя потенциальные буквы случайным образом и разбираясь, работает ли фермент с ними. Через некоторое время среди 3 600 пар кандидатов нашлась одна подходящая. "

Так что ДНК может быть не менее необычной, чем эта новая искусственная ГНК
 

Kamille

Консул
Все эти синтетические ДНК интересны прежде всего для нанотехнологий. Для создания нанороботов или для изучения естестенной ДНК, ее структуры или для анализа генома.
 

Kamille

Консул
http://elementy.ru/news/430749
Американские биологи сделали важный шаг к пониманию начальных этапов зарождения жизни. Им удалось создать «протоклетку» с оболочкой из простых липидов и жирных кислот, способную втягивать из окружающей среды активированные нуклеотиды — «кирпичики», необходимые для синтеза ДНК. Протоклетка не может самостоятельно осуществлять матричный синтез (репликацию) ДНК от начала и до конца, но успешно справляется с важнейшими этапами этого процесса, причем все реакции идут без участия каких-либо белков или других сложных биологических молекул-катализаторов.
Авторы исходили из того, что мембрана протоклетки вовсе не обязательно должна была состоять из тех же самых липидов, что и мембраны современных клеток. Кстати, первичным «веществом наследственности» тоже вовсе не обязательно должны были быть ДНК или РНК в их нынешней форме. Устойчивые двухслойные мембраны (и пузырьки, окруженные такими мембранами) получаются из множества различных липидов, жирных кислот, спиртов и других амфифильных соединений (то есть имеющих полярную гидрофильную «голову» и гидрофобный углеводородный «хвост»). .........
Авторы нашли несколько вариантов состава мембраны, при которых ее проницаемость для рибозы оказывается высокой. Дальнейшие эксперименты проводились с двумя из этих вариантов. Первый из них — смесь миристолеиновой кислоты (Myristoleic acid) с ее же глицериновым моноэфиром (glycerol monoester of myristoleic acid). Эта смесь дает устойчивые пузырьки с хорошей проницаемостью, но у нее есть один недостаток: миристолеиновая кислота содержит 14 атомов углерода и одну двойную связь, и ее присутствие в «первичном бульоне» в достаточно высоких концентрациях считается маловероятным. Второй вариант — смесь декановой кислоты (Decanoic acid) с соответствующим глицериновым моноэфиром и декановым спиртом. Эта смесь ближе к реальности (то есть к тому, что могло быть в первичном бульоне), потому что в декановой кислоте всего 10 атомов углерода и нет двойных связей
Затем авторы приступили к изучению проницаемости этих пузырьков по отношению к активированным нуклеотидам — тем «кирпичикам», из которых клетка собирает молекулы РНК и ДНК. Если реальные протоклетки были гетеротрофами, такие нуклеотиды должны были составлять их главную «пищу». Современные клетки используют нуклеотиды с тремя присоединенными к ним остатками фосфорной кислоты (нуклеотид-трифосфаты). Однако нуклеотид-трифосфаты, как выяснилось, наотрез отказываются проходить сквозь любые липидные мембраны. Причина в том, что они несут слишком сильный отрицательный заряд. У нуклеотид-дифосфатов и нуклеотид-монофосфатов заряд меньше, и им удается пройти сквозь миристолеиновые и декановые мембраны, но из таких «кирпичиков» ДНК сама собой не синтезируется.

Однако и здесь нашелся обходной путь. Нуклеотиды можно активировать иным способом — присоединив к ним вместо трех фосфатов один фосфат и молекулу имидазола (имидазол — простое органическое соединение, широко распространенное в живой природе и представляющее собой кольцо из трех атомов углерода и двух атомов азота; имидазол является составной частью одной из 20 «канонических» аминокислот — гистидина). Нуклеотиды, активированные имидазолом, годятся для синтеза ДНК и РНК, но имеют только один отрицательный заряд, а не четыре, как нуклеотид-трифосфаты. Такие нуклеотиды уже применялись ранее в экспериментах по синтезу нуклеиновых кислот без участия ферментов.

Многие исследователи допускают, что на заре жизни для синтеза нуклеиновых кислот могли использоваться не нуклеотид-трифосфаты, как теперь, а нуклеотиды, активированные имидазолом. Такие нуклеотиды даже лучше справляются с данной работой, чем нуклеотид-трифосфаты, особенно при отсутствии белков-катализаторов. Авторы обсуждаемой статьи добавляют к этому еще одно соображение: они предполагают, что переход от нуклеотидов, активированных имидазолом, к менее эффективным нуклеотид-трифосфатам был обусловлен необходимостью предотвратить утечку нуклеотидов из клетки (нуклеотид-трифосфаты, как мы помним, сквозь мембраны не проходят). Это, конечно, произошло уже тогда, когда клетки научились сами синтезировать строительные блоки для синтеза нуклеиновых кислот и перестали «всасывать» их извне.

Как и ожидалось, нуклеотиды, активированные имидазолом, достаточно свободно проходили сквозь миристолеиновые и декановые мембраны. Этот успех вдохновил авторов на попытку создания искусственной протоклетки, которая «питалась» бы активированными нуклеотидами и осуществляла матричный синтез (репликацию, копирование, размножение) молекул ДНК или РНК без помощи ферментов.
пузырьки с начинкой — модельные протоклетки — поместили в среду, оптимальную для неферментативного синтеза ДНК (pH 8,5, температура 4°C, плюс еще два простых органических соединения, теоретически совместимых с представлениями о первичном бульоне). После этого протоклетки стали получать «пищу» — активированные нуклеотиды. Официальное название «корма»: 2'-амино-2',3'-дидеоксигуанозин-5'-фосфоримидазол. Время от времени часть протоклеток извлекалась из раствора, чтобы посмотреть, как идет репликация.

Шла она хорошо, хоть и медленно. В конце концов все протоклетки справились с задачей, то есть закончили репликацию недореплицированных молекул ДНК, пристроив к каждому из 15 цитидинов (Ц) комплементарный ему гуанозин (Г). На это у них ушло 24 часа, по 96 минут на нуклеотид. В настоящих живых клетках репликация ДНК осуществляется в десятки миллионов раз быстрее, но ведь там есть сверхэффективные катализаторы — ферменты.
 

b-graf

Принцепс сената
вроде то же - в кратком изложении:

Биологи создали искусственную клетку
16.05.2008 20:55 | www.rian.ru
http://www.rambler.ru/news/science/0/562242536.html
"Биологи из Пенсильванского университета (США) создали искусственную клетку…, чтобы с ее помощью изучить организацию и функции двух из главных компонентов клеток - мембраны и цитоплазмы, студенистой жидкости, которая окружает "внутренние органы" живой клетки.»
"Многие ученые пытались понять клетки, "выключая" по одному ее гены и наблюдая, как это сказывается на ее функциях. Но мы пошли противоположным путем"
"Мы начали с малого, добавляя компоненты, чтобы найти, что необходимо для стимуляции большинства основных клеточных функций»
«мы хотим понять физические принципы, которые управляют биологическими системами»

Это об одном и том же ?
 

Kamille

Консул
Не, не то. В первом случае идея в том, чтобы подобрать состав сравнительно просто устроенной работающей клеточной мембраны, которая могла бы поглощать питательные и энергетические вещества извне без специфических транспортных систем. А заодно подобрать к ней набор таких веществ. Причем не искустсвенных, а имеющих реальную возможность работать в естественных условиях. Авторы доказывают, что это возможно и заодно то, что первичные клетки были гетеротрофами. Зну и демонстрируют синтез олигонуклеотидов прошел без ферментов.

Во втором случае речь не идет о вопросах зарожения жизни. Работа больше биофизическая. Предлагается довольно простая искусственная модель для изучения процесса поляризации клетки, создания неравномерности распределения белков и др. веществ в матриксе цитоплазмы. Полярность - важнейшее свойство клетки, определяющее распредление органелл внутри клетки, веществ матрикса, траснпорт внутри клетки, пллоскость деления клетки, распознавание внеклеточного окружения, дифференцировки клеток, обеспечивающее в конечном счете развитие организма. Свойство, конечно, многофакторное, так что это лишь один из многих путей его изучения. Все это перекликается и с проблемой развития рака, и со стволовыми клетками.
 

Kamille

Консул
НА ДЕНЬГИ ГЕЙТСА
До сих пор ученым удавалось конструировать отдельные биологические блоки, но создать полностью новый самовоспроизводящийся организм им еще предстоит. «Химический синтез жизни – одна из задач, всегда стоявших перед синтетической органической химией», – говорит самый известный адепт SynBio Крейг Вентер.

Но создание жизни с нуля для ученых – не самоцель. Они подходят к своей работе утилитарно. Исследователи от SynBio вполне готовы для пользы дела просто сшивать созданные в лаборатории биологические компоненты, или «биоустройства», с частями живых клеток, создавая таким образом организмы-гибриды. Это уже вполне прагматическая сфера деятельности, которая скоро принесет плоды. Джордж Черч из Гарварда считает, что результат будет получен уже через два года при условии, что на исследования будут выделять больше средств.

С июня 2004 г., когда Массачусетский технологический институт провел первую конференцию по синтетической биологии, исследователи разработали и выпустили тысячи программируемых биоустройств – деталей генетического механизма, который, если его собрать, сможет выполнять более сложные задачи.

Эти живые устройства, как предполагается, будут иметь огромные преимущества. Они смогут производить любые фармацевтические препараты, какие только можно себе представить, включая такие, которые невозможно создать с помощью традиционной химии, или слишком дорогостоящие на данный момент. Подобным же образом они могут создавать любое другое химическое вещество или полимер для производства пластмасс, натуральное дерево или шелк – и все это будет обходиться в несколько раз дешевле, чем сейчас.

На самые известные проекты в сфере SynBio уходят десятки миллионов долларов, но принести они могут на порядки больше. Один из них – проект Билла Гейтса и Джея Кислинга по созданию организма, который будет производить мощный противомалярийный препарат.

В прошлом с малярией эффективно боролись лекарства, содержащие хинин, но с тех пор по планете распространились резистентные штаммы паразита. Артемизинин - продукт на основе горькой полыни, высокоэффективен при лечении пациентов с хинино-резистентной формой малярии, но его никак не получается производить в больших количествах.

В 2004 г. Кислинг, инженер-химик из Беркли, убедил Фонд Билла и Мелинды Гейтс выделить $42 млн на его проект. Кислинг начинал с обыкновенных хлебопекарных дрожжей. Эволюция «запрограммировала» дрожжи на переработку сахара и производство различных биохимических веществ. В этот уже функционирующий организм Кислинг добавил разработанную в лаборатории генетическую программу, составленную из 12 новых генов. Она изменила метаболизм дрожжей, и те стали производить артемизинин. В апреле 2006-го Кислинг объявил, что ему остался всего один шаг до получения окончательного соединения и он планирует выйти на финишную прямую до 2009 г. Как только это будет сделано, появится новый, дешевый и эффективный источник артемизинина, которого хватит, чтобы вылечить всех больных малярией в мире. Нужна будет лишь горстка сахара и немного дрожжей в бродильном чане. «Мы строим современные химические фабрики будущего», - гордо говорит теперь Кислинг.

Медицинский аспект SynBio увлек и калифорнийских ученых Кристофера Войта и Кристину Смолке. Сейчас они находятся на ранних стадиях разработки микробов, которые, циркулируя вместе с током крови по всему организму человека, находили бы раковые опухоли. Этих микробов можно будет снарядить биоустройствами, одно из которых выявляло бы низкие уровни кислорода, характерные для опухоли, другое – проникало бы в клетки, третье вырабатывало токсин, убивающий эти клетки, а четвертое оставалось «дежурить» на случай, если рак вернется. Со временем эти клеточные «караульные» смогли бы контролировать и регулировать уровень в крови различных жизненно-важных субстанций, включая глюкозу и холестерол.

СВЕТОВОЕ ТОПЛИВО

Но самыми громкими должны стать проекты тех же Крейга Вентера и Джорджа Черча. Они замахнулись на создание самоподдерживающегося, высокоэффективного организма, который преобразует солнечный свет непосредственно в чистое биотопливо. «Наиболее устойчивый источник энергии – солнечный свет, и наиболее доступные продукты – нефтепродукты, пригодные к транспортировке трубопроводом, – говорит Черч. – Так что я буду стремиться к созданию долговечной системы предприятий, которые синтезировали бы чистые химикаты – октан, дизель и т. д. – и могли бы поставлять их прямо в трубы без дополнительного очищения».

Вентер ведет похожие исследования – создает искусственную хромосому, которая станет генетической основой для «энергомикробов». Если ему это удастся, он станет легендой. Впрочем, он и так легенда. Вентер прославился, когда ему удалось расшифровать человеческий геном – собственную ДНК, – потратив на это в 10 раз меньше денег и времени, чем требовалось согласно прогнозам. Произошло это в конце 90-х, когда он руководил компанией Celera Genomics, которая в одиночку соревновалась с глобальным международным проектом расшифровки генома. Вентер делал это не только ради науки, но и чтобы заработать – идея была в том, чтобы создать онлайновую генетическую базу с платным доступом. Коллег-генетиков эта идея возмущала, а когда оказалось, что получить прибыль невозможно, основателя Celera Genomics Вентера уволили из собственной компании. Это случилось в 2002-м, два года спустя после того, как Вентер, его конкурент Фрэнсис Коллинз из проекта «Геном человека» и президент США Билл Клинтон торжественно заявили, что геном наконец расшифрован.

Теперь он вложил десятки миллионов долларов собственных денег в SyntheticGenomics, свою новую компанию, созданную специально для разработки искусственных организмов. На сей раз он рассчитывает на огромную прибыль: его «детища» должны будут преобразовывать солнечный свет непосредственно в биотопливо с минимальным ущербом для окружающей среды и нулевым выходом парниковых газов. Эти организмы, говорит он, «заменят нефтехимическую промышленность, большую часть пищи, будут участвовать в биоочистке почвы и выработке экологически чистой энергии».
http://www.sibai.ru/index.php?Itemid=723&i...ntent&task=view
 

b-graf

Принцепс сената
Исследователи научились перепрограммировать живые клетки
3 сентября 2008
http://www.membrana.ru/lenta/?8575
"Мелтон и его коллеги нашли способ превращения прямо в теле животного (в данном опыте — мыши) экзокринных клеток, составляющих приблизительно 95% поджелудочной железы, в драгоценные и редкие производящие инсулин β-клетки."
 
Верх