Могила Марии, супруги императора Гонория, была случайно обнаружена 4 февраля 1544 г. при земляных работах в капелле св. Петрониллы, прилегавшей к старому собору св. Петра в Ватикане.
Это был двойной саркофаг. Наружный был из египетского красного гранита, он был отправлен в ватиканский дворец.
Внутренний имел овальную форму (labium seu labrum), он был сделан из "драгоценнейшего чернейшего лидийского мрамора". Внутри лежали останки императрицы в шитых золотом одеждах (veste ex auro), там же находилась шкатулка с множеством драгоценностей (описание имеется).
Одежды были сожжены, выплавленное золото поступило в распоряжение Папы. Все сокровища также были присвоены Папой (quae omnia habuit Paulus papa tertius). Это, по-видимому, был самый богатый саркофаг из всех когда-либо разграбленных папами. Останки Марии были захоронены в полиандруме (нечто вроде братской могилы) вместе с останками Терманции, Агнессы, супруги Генриха II, и пр. обитателей вскрытых могил этой капеллы. Могилу Гонория обнаружить не удалось.
Саркофаг Марии был довольно большой длины, в рост мужчины (14 х 11 ладоней), поэтому Павел III решил им воспользоваться.
Его надгробный памятник был сделан Гульельмо делла Порта и установлен в соборе св. Петра симметрично памятнику Урбану VIII.
Сам саркофаг поставлен на основание гробницы из белого мрамора и розового камня (видимо, портасанта) и закрыт резными мраморными панелями. На передней панели имеется овальное окно, через которое виднеется черный мрамор саркофага Марии. Он накрыт новой массивной крышкой из белого мрамора. На крышке установлена статуя Папы.
