30 мая 1961 года Трухильо поехал в свой родной город Сан-Кристобаль около 22:00. Он был «как всегда властен» (Die Zeit)
[2] без телохранителя. Отряд из семи человек выстрелил из машины в голубой
Chevrolet Bel Air Трухильо. Пострадавший выскочил из машины и попытался выстрелить в темноте. Затем он потерял сознание и умер. Его тело было перевезено в его родной город Сан-Кристобаль и первоначально там похоронено. На торжественных государственных похоронах президент Балагер произнес похоронную речь.
... после смерти Рафаэля Трухильо клан Трухильо не мог дольше удерживать власть. После военного восстания в ноябре 1961 года семья по настоянию президента
Джона Ф. Кеннеди была вынуждена покинуть страну.
Первоначально Рамфис тщетно пытался бежать на своей парусной яхте
Angelita (сегодня:
Sea Cloud ) с
эксгумированным телом своего отца на борту. Затем Балагер позволил ему и его семье уехать в Париж. Тело Трухильо было также перевезено на яхте в Париж и похоронено 14 августа 1964 года на
кладбище Пер-Лашез , где до сих пор находится его погребальная часовня (Дивизион 85). В 1970 году останки были снова эксгумированы, привезены в Испанию и захоронены 19 ноября на кладбище в
мадридском районе Эль-Пардо. Там кости Трухильо покоятся рядом с костями его сына Рамфиса в мавзолее из черного мрамора