ДНК-генеалогия

asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
Волков В.Г., Каримов А.А., Сабитов Ж.М. Юсупов Ю.М. Происхождение и родственные связи башкир рода Кыпчак по данным генетических исследований// История башкирских родов. Кыпчак. Том 34. Уфа: ИИЯЛ УНЦ РАН; Китап, 2019. С. 295-310.
https://www.academia.edu/40018155/%D0%92%D0...%D0%A1._295-310
 
N

NoName

Военный трибун
А вот мне любопытно, если позволите, как распространен "монгольский ген" среди африканцев? :) Ведь хорошо известно из истории что монголы дошли практически до Африки (где им наваляли мамлюки Бейбарса)..

Вот, например, смотрю на старое фото с Арабо-африканского саммита в Ливии в 2010г:
https://www.middleeasteye.net/sites/default...g?itok=T0BwEPXW

Один из лидеров, на плечи которого Каддафи положил руки. Если б не цвет кожи, можно было б подумать, что монгол или японец :)

На фото ниже он стоит за Каддафи:
https://static.timesofisrael.com/www/upload...oro-640x400.jpg

Это президент Джибути Исмаил Омар Гелле или кто-то другой, не знаю.
 
N

NoName

Военный трибун
Вопрос отменяется :) Мне тут подсказали, что на фото Жан Пин, сын китайца и габонки.
 
asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
Перепост:
https://nplus1.ru/news/2019/10/02/ancient-strain

В Поволжье обнаружили древнейшего возбудителя средневековой пандемии чумы

В Поволжье обнаружили древнейший штамм чумной палочки, которая стала виновницей средневековой пандемии в Европе, говорится в Nature Communications. Палеогенетики получили геном этой бактерии из останков, найденных в городе Лаишево в Татарстане. Она дала начало линиям, которые распространились в Европе и неоднократно вызывали вспышки заболевания в разных частях континента. По мнению авторов, говорить о точном происхождении возбудителя Черной смерти пока рано, и нужны дополнительные исследования.

https://www.nature.com/articles/s41467-019-12154-0

Phylogeography of the second plague pandemic revealed through analysis of historical Yersinia pestis genomes

    Maria A. Spyrou, Marcel Keller, Rezeda I. Tukhbatova, Christiana L. Scheib, Elizabeth A. Nelson, Aida Andrades Valtueña, Gunnar U. Neumann, Don Walker, Amelie Alterauge, Niamh Carty, Craig Cessford, Hermann Fetz, Michaël Gourvennec, Robert Hartle, Michael Henderson, Kristin von Heyking, Sarah A. Inskip, Sacha Kacki, Felix M. Key, Elizabeth L. Knox, Christian Later, Prishita Maheshwari-Aplin, Joris Peters, John E. Robb, Jürgen Schreiber, Toomas Kivisild, Dominique Castex, Sandra Lösch, Michaela Harbeck, Alexander Herbig, Kirsten I. Bos & Johannes Krause - Show fewer authors

Nature Communications volume 10, Article number: 4470 (2019) | Download Citation

Abstract

The second plague pandemic, caused by Yersinia pestis, devastated Europe and the nearby regions between the 14th and 18th centuries AD. Here we analyse human remains from ten European archaeological sites spanning this period and reconstruct 34 ancient Y. pestis genomes. Our data support an initial entry of the bacterium through eastern Europe, the absence of genetic diversity during the Black Death, and low within-outbreak diversity thereafter. Analysis of post-Black Death genomes shows the diversification of a Y. pestis lineage into multiple genetically distinct clades that may have given rise to more than one disease reservoir in, or close to, Europe. In addition, we show the loss of a genomic region that includes virulence-related genes in strains associated with late stages of the pandemic. The deletion was also identified in genomes connected with the first plague pandemic (541–750 AD), suggesting a comparable evolutionary trajectory of Y. pestis during both events.
Нажмите, чтобы раскрыть...
 
asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
Начались скидки. Наиболее ценные: Family Finder ------------------------------------------ $79 $59
Y-37 ------------------------------------------------------- $169 $99
Big Y-700 ------------------------------------------------ $649 $399
Upgrades
Y-12 to Big Y-700* ------------------------------------- $629 $359
Y-25 to Big Y-700* ------------------------------------- $599 $349
Y-37 to Big Y-700* ------------------------------------- $569 $319
Y-67 to Big Y-700* ------------------------------------- $499 $259
Y-111 to Big Y-700* ------------------------------------ $449 $229
Бам-файл стоит отдельно 99 долларов
 
asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
О ПРОИСХОЖДЕНИИ КАЗАХСКОГО ПЛЕМЕНИ ЖАЛАЙЫР

Е.Е. Аширбеков1 , Н.А. Айтхожина

1-Институт молекулярной биологии и биохимии им. М.А.Айтхожина КН МОН РК, Республика Казахстан, 050022, г. Алматы, Досмухамедова, 86 e-mail: eldarasher@mail.ru 

Существует три гипотезы происхождения казахского племени Жалайыр – монгольская, тюркская и смешанная. Среди тех, кто придерживался версии о монгольском происхождении, были Ш.Ч. Валиханов, В.В. Бартольд, М.Т. Тынышпаев и др. По мнению Ю.А. Зуева, поддерживаемого Б.К. Асановым, в XII-XIII вв. многие изначально тюркские племена, в том числе жалаиры, по политическим причинам стали «монголами». Н.А. Аристов, С.А. Аманжолов, В.В. Востров и М.С. Муканов считали, что племя имеет смешанное тюрко-монгольское происхождение. Согласно М.Т. Тынышпаеву в XIII в. жалаиры были разделены на четыре группы, две из которых стали основой для ветвей казахских жалайыров: Шуманақ и Сырманақ. При этом шуманаки произошли жалаиров, кочевавших восточнее реки Шу, и входивших в состав армии Урус-хана (умер в 1377 г.) и его сыновей, а сырманаки – от остатков разгромленной Тимуром в 1370 г. Джалаирской орды.

Мы попытались пролить свет на существующие гипотезы, исследовав разнообразие Yхромосомы 93 казахов из племени Жалайыр: 28 представителей Шуманақ, 40 представителей Сырманақ, 25 человек – без сведений о роде. В результате выявлено 15 гаплогрупп Yхромосомы, из которых 10 встречались как минимум дважды: С2-F4002 (N = 39), J2a-M410 (13), N1-M46 (9), G2-P287 (6), R2-M124 (5), G1-M285 (5), R1a-M198 (3), J1-M267(3), C2-M48 (3), I2aL621 (2). Для всех изученных родов Шуманақ (Андас, Мырза, Сыпатай, Қалпе и Орақты) основной гаплогруппой явилась С2-F4002. В роде Мырза также обнаружена J2a. Группа Сырманақ оказалась гораздо более разнородной. Вышеупомянутая C2-F4002 преобладала в роде Күшік, у всех представителей рода Сиыршы выявлена гаплогруппа G2, для рода Балғалы были характерны гаплогруппы R2-M124 и I2a-L621, для рода Байшегір – N1-M46 и J2a.

Анализ медианных сетей STR-гаплотипов жалайыров линии C2-F4002 показал их близость между собой и обособленность относительно представителей других казахских племен. То же самое наблюдалось для гаплотипов линий J2a, N1-M46, G2 и R2-M124. Поиск по базе YHRD выявил близкие гаплотипы для линий C2-F4002 (в популяциях монголов, хазарейцей, уйгуров, Северного Китая и др.), N1-M46 (монголов, хазарейцев и уйгуров), J2a (уйгуров), I2a-L621 (венгров), G2 (цыган Венгрии и греков). Полученные результаты свидетельствуют об однородности группы Шуманақ, в то время как Сырманақ представляет собой сборную группу. Распространение линии C2-F4002 (известной как Starcluster) в мировых популяциях совпадает с путями экспансии монголов в XIII веке, и, по мнению исследователей вопроса, маркирует вклад завоевателей в генофонд покоренных народов. Ее преобладание в группе Шуманақ и роде Күшік говорит об их монгольском происхождении. Обнаружение близких гаплотипов линии N1-M46 у монголов и хазарейцев позволяет считать эту линию также монгольской. Выявленные линии гаплогрупп J2a, I2a-L621, G2 и R2-M124 вероятно, присутствовали в Центральной Азии в домонгольское время.

стр.19

http://imbb.org.kz/wp-content/uploads/2019...konferencii.pdf
Нажмите, чтобы раскрыть...
 
asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
Волков В.Г., Тычинских З.А., Лавряшина М.Б., Балановская Е.В. Генофонд сибирских татар в контексте археологических и исторических данных. //Коренные народы Сибири: история, традиции и современность. Материалы региональной научно-практической конференции с международным участием (Новосибирск, 4 октября 2019 г.)/ Отв.ред. Доможакова О.П. Новосибирск: Изд-во , 2019.  С.65 - 74.

https://www.academia.edu/41588994/Волков_В....рических_данных
 
asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
Перепост. A massacre of early Neolithic farmers in the high Pyrenees at Els Trocs, Spain (2020) - https://www.nature.com/articles/s41598-020-58483-9
Y-DNA Table 1 https://www.nature.com/articles/s41598-020-58483-9#Tab1
https://www.dailymail.co.uk/sciencetech/art...-years-ago.html
В Испании археологи сообщили подробности открытия, сделанного в Пиренеях. В одной из пещер были найдены останки девяти человек, жестоко убитых около 7300 лет назад.
Отчет об открытии можно найти в журнале Nature Scientific Reports. Оно было сделано на высоте 1500 метров над уровнем моря в испанских Пиренеях, в живописной горной местности региона Уэска.
При проведении раскопок в пещере под названием Эль-Трокс археологи обнаружили останки девяти человек, умерших около 7300 лет назад. Из них четверо были детьми в возрасте от трех до семи лет, а остальные - взрослыми. Анализ останков показал, что эти люди, вероятно, были жестоко убиты.
Радиоуглеродное датирование, проведенное в Мангеймской лаборатории в Германии, показало, что их смерть наступила между 5326 и 5067 годами до нашей эры. Это как раз тот период времени, когда охотники-собиратели на территории Европы переходили к оседлому образу жизни.
Следы насилия были найдены на всех изученных человеческих останках. У взрослых, например, идентифицированы раны, нанесенные выстрелами из лука. Детские скелеты сохранили следы нанесения ударов тупыми предметами. Все это привело археологов к выводу, что обнаруженные люди стали жертвами расправы.
О ее причинах можно только догадываться. Кстати, ранее подобных свидетельств массовой расправы в этих местах не находили. Однако подобные сюжеты встречались в пиренейской наскальной живописи. Они изображают батальные сцены между враждующими группами людей, причем в руках у них видны луки со стрелами. "На вопрос о виновниках этого "преступления" нельзя ответить прямо, - пишут исследователи. - Археологически они почти ничего не оставили после себя. Однако на основе общего контекста можно описать альтернативные сценарии и оценить их вероятность". Ученые предполагают, что поводом для расправы мог послужить территориальный спор или, например, кража скота или женщин из соседнего племени. Кстати, генетический анализ показал, что убитые могли быть представителями первой волны мигрантов неолита. Считается, что около 10 тысяч лет назад переселенцы с Ближнего Востока распространились по всей Европе. Поэтому ученые не исключают, что они нашли следы одного из первых массовых межнациональных конфликтов. Открытие в пещере Эль-Трокс, которое сами исследователи называют ужасающим, тем не менее оказалось очень важным. Оно подтверждает гипотезу о том, что преднамеренное "коллективное насилие" появилось в эпоху неолита, на заключительной стадии первого этапа развития земледельческой культуры, то есть в конце шестого - начале тысячелетия до н.э. Кроме того, по своему масштабу события в Эль-Троксе не имеют археологических аналогов в Европе. Еще одной необычной особенностью является удаленное географическое расположение пещеры - она значительно удалена от путей миграции раннего неолита на Пиренейском полуострове.К слову, в пещере также были обнаружены остатки керамических изделий и каменных орудий труда, кости убитых домашних и диких животных.

CET 1 5–6 n.d. f J1c3 (-) BFT Phase I 5311–5218 (MAMS 16159) a,bHaak et al. 2015 aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 2  > 20 m? m J1c1b I2a1a Phase II 3933–3709 (MAMS 16160) aSzécsényi-Nagy et al. 2017 cVillalba-Mouco et al. 2019
CET 3 30–50 m m pre-T2c1d2 R1b1 Phase I 5294–5066 (MAMS 16161) a,bHaak et al. 2015 aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 4 3.5–4.5 n.d. m K1a2a F* BFT Phase I 5294–5068 (MAMS 16162) a,bHaak et al. 2015 aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 5 30–50 m m N1a1a1 I2a1b1 Phase I 5310–5080 (MAMS 16164) a,bHaak et al. 2015 aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 6 25–40 m? m U3a1 I2a1a Phase II 3946–3767 (MAMS 16165) aSzécsényi-Nagy et al. 2017 cVillalba-Mouco et al. 2019
CET 7 3–4 n.d. f V (-) BFT Phase I 5303–5075 (MAMS 16166) a,bHaak et al. 2015 aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 8 6–8 n.d. n.d. H1 n.d. Phase III 3350–3101 (MAMS 16167) aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 9  > 30 n.d. n.d. n.d. n.d. post Phase III assigned stratigraphically
CET 10 50–70 f n.d. K n.d. AHT and BFT peri and post Phase I 5310–5078 (MAMS 16168) aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 11 6–7 f? n.d. n.d. n.d. BFT peri and post Phase I 5312–5219 (MAMS 16163)
CET 12 30–50 m n.d. T2 n.d. BFT peri and post Phase I 5218–5034 (MAMS 40100) aSzécsényi-Nagy et al. 2017
CET 13  > 20 n.d. n.d n.d. n.d. AHT and BFT peri and post Phase I assigned stratigraphically
CET-F22580  > 20 n.d. n.d. n.d. n.d. AHT peri Phase I assigned stratigraphically
CET-F22567  > 20 n.d. n.d. n.d. n.d. AHT peri Phase I assigned stratigraphically
 
asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-05/mpif-tou050820.php

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2259-z

При исследовании пещеры Бачо Киро в Болгарии были обнаружены остатки костей человека. Радиоуглеродное датирование показало возраст в 45 000 лет. Пока проанализировали только митохондриальную ДНК, но лаборатория Паабо сейчас пытается получить полный геном. Из анализа ДНК ясно что это сапиенсы. Так что это на данный момент древнейшие останки Homo Sapiens в Европе.
Нажмите, чтобы раскрыть...
 
asan-kaygy

asan-kaygy

Цензор
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/ajpa.24076

Ancient DNA reveals two paternal lineages C2a1a1b1a/F3830 and C2b1b/F845 in past nomadic peoples distributed on the Mongolian Plateau

Jiawei Li, Dawei Cai, Ye Zhang, Hong Zhu, Hui Zhou

First published: 14 May 2020
https://doi.org/10.1002/ajpa.24076

Abstract

Objectives

Since the third century CE, a series of nomadic tribes have been active on the eastern part of the Mongolian Plateau. Characterizing the genetic compositions of past nomadic people is significant for research on the nomadic cultures of the Eurasian Steppe region. Ancient DNA analysis facilitates a deeper understanding of the relationship between historical and modern nomadic populations.

Materials and methods

Whole‐genome shotgun sequencing and capture sequencing of the nonrecombining region of the Y chromosome were performed for six ancient Hg C2/M217 individuals. The individuals were interred at six separate sites on the Mongolian Plateau and represent dates spanning the late Neolithic to Yuan Dynasty (~3,500–700 BP).

Results

After NRY capture sequencing, three of the six ancient samples were attributed to C2b1b/F845 and the other three ancient samples belonged to C2a1a1b1a/F3830. Analysis of whole‐genome shotgun sequencing data shows that the ancient C2b1b/F845 individuals are closely related to She, Han and other East Asian populations, while the ancient C2a1a1b1a/F3830 individuals are more similar to modern Northeast Asian peoples, such as the Ulchi and Yakut.

Discussion

Hg C2/M217, widely distributed in the eastern part of the Eurasian continent, was discovered in the ancient Central Steppe and Baikal region. This study shows that there were two important subclades of Hg C2/M217 among the ancient nomadic peoples: C2a1a1b1a/F3830, which has made important genetic contributions to modern Mongolic‐ and Manchu‐speaking populations, and C2b1b/F845, which probably originated in the farming populations of southern East Asia and made certain genetic contributions to past nomadic peoples on the Mongolian Plateau.

Аннотация

Цели

Начиная с третьего века нашей эры, в восточной части Монгольского нагорья активно действовал ряд кочевых племен. Характеристика генетического состава кочевых народов прошлого имеет важное значение для исследований кочевых культур Евразийского степного региона. Анализ древней ДНК способствует более глубокому пониманию взаимосвязи между историческими и современными кочевыми популяциями.

Материалы и методы

Цельногеномное дробовое секвенирование и захватное секвенирование нерекомбинирующей области Y-хромосомы были выполнены для шести древних индивидуумов с гаплогруппой Y-хромосомы C2/M217. Эти индивидуумы были погребены в шести разных местах на Монгольском нагорье и представляют собой даты, охватывающие период от позднего неолита до династии Юань (~ 3500-700 лет назад).

Результаты

После секвенирования захвата нерекомбинирующей области Y-хромосомы три из шести древних образцов были отнесены к C2b1b/F845, а три других древних - к C2a1a1b1a/F3830. Анализ данных секвенирования всего генома показывает, что древние особи с C2b1b / F845 тесно связаны с популяциями шэ, ханьцами и других восточноазиатскими народами, в то время как древние особи с C2a1a1b1a / F3830 больше похожи на современные народы Северо-Восточной Азии, такие как ульчи и якуты.

Обсуждение

Гаплогруппа C2/M217, широко распространенная в восточной части Евразийского континента, была обнаружена в древней Центральной степи и Байкальском регионе. Это исследование показывает, что у древних кочевых народов была два важных субклада гаплогруппы C2 / M217: C2a1a1b1a / F3830, которая внесла важный генетический вклад в современные монголоязычные и маньчжурские популяции, и C2b1b / F845, которая, вероятно, возникла в земледельческих популяциях южной части Восточной Азии и внесла определенный генетический вклад в прошлые кочевые народы на Монгольском плато.
Нажмите, чтобы раскрыть...
 
Для ответа нужно войти/зарегистрироваться
Верх