Во-первых, ЕМНИП, разница пошла из-за того, что в Константинопольской церкви был принят Студийский устав, а в РПЦ - Иерусалимский.
Хотя, конечно, больше влияло именно церковное предание (в частности в вопросах перстосложения, числа просфор на проскомидии, сугубой или трегубой аллилуйи...